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乙型肝炎病毒感染的肝癌患者肝组织中乙型肝炎病毒cccDNA的检测

作者:张涛 韩涛 高英堂 陈浩 杜智 王毅军 来源: 日期:2010-5-30 17:33:48 人气: 标签:



【关键词】 癌,肝细胞; 肝炎病毒,乙型; 共价闭合环状DNA
Detection of hepatitis B virus cccDNA in liver tissues of patients with hepatocellular carcinoma ZHANG Tao, HAN Tao, GAO Ying-tang, CHEN Hao, DU Zhi, WANG Yi-jun.
【Key words】 Carcinoma, hepatocellular; Hepatitis B virus; Covalently closed circular DNA
【First author’s address】 Institute of Hepatobiliary Diseases, Tianjin Third Central Hospital, Tianjin 300170, China
Corresponding author: HAN Tao,
HBV属嗜肝DNA病毒家族,其基因组是双链松弛环状DNA (rcDNA),相对分子量为(1.6~2.0)×109,全长约为3.2kb。在HBV的生命周期中,共价闭合环状DNA(cccDNA)是HBV的原始复制模板,对HBV的复制及感染状态的建立具有十分重要的意义[1]。清除HBV cccDNA是目前抗HBV药物研究的一个重要目标[2, 3]。我们对天津市第三中心医院收治的20例HBV感染的肝癌患者肝组织(包括癌组织及癌旁组织)中cccDNA的存在状况进行了检测分析。
一、材料与方法
1.主要试剂及仪器:Taq酶、dNTP、氯化镁溶液、超纯水和DNA分子量标准等购自大连宝生物公司。Tris饱和酚(pH8.0)、氯仿、异戊醇购自上海生工生物工程公司。Tris碱、EDTA、十二烷基硫酸钠、蛋白酶K购自美国Promega公司。Plasmid-SafeTM ATP依赖性DNA酶购自美国Epicentre公司。DNA分子量标准购自北京鼎国生物技术有限责任公司。HBV DNA PCR荧光定量诊断试剂盒购自上海复星实业有限公司。PCR扩增仪购自杭州大和热磁有限公司,全自动凝胶图像分析系统(GIS-2010)购自上海天能科技公司。
2.标本:40份肝组织为20例肝癌患者的癌与癌旁配对手术切除标本,均取自天津市第三中心医院2004年4月-11月住院患者,其中男14例,女6例;年龄最大72岁,最小37岁,平均年龄60.67岁。所有肝癌病例均切取了肿瘤原位组织、癌旁组织,诊断符合2001年肝癌诊断标准[4];病理结果表明,癌组织为原发性肝细胞癌,癌旁组织为肝硬化或者正常肝组织,手术切缘处无癌细胞残留。所有肝癌患者HBsAg、抗HBe、抗HBc IgG阳性,HBeAg阴性,并且均未进行过抗病毒治疗。
3. 肝组织中HBV DNA及cccDNA含量的检测:(1)提取肝组织中总DNA:对每例肝癌患者均提取癌组织及癌旁组织的总DNA,采用常规蛋白酶K消化、酚-氯仿抽提,产物溶解于100μl TE缓冲液中,取4μl经20g/L琼脂糖凝胶电泳,并测量总DNA的含量。(2)提取肝组织中HBV cccDNA:取1μg总DNA用Plasmid-SafeTM ATP依赖性DNA酶常规酶切[3],于70℃水浴30min以灭活该酶。(3)引物设计:基于rcDNA的正链和负链上均存在缺口,故可以设计跨越两个缺口的引物,使rcDNA不被扩增,而cccDNA由于有完整的双链可以被有选择性地扩增。正义引物LB21(nt1545~1575):5′-GTCTCCCCGTCTGTGCCTTCTC ATCTGCCGG-3′;反义引物LB10(nt2279~2310):5′-CTCCGAAAGAGACCAAATACTCAAGGACAGTT-3′。另设计一对引物位于负链缺口上游,可同时扩增rcDNA和cccDNA:正义引物P29(nt246~266):5′-GAGTCTAGA CTCGTGGTGGAC-3′;反义引物P125(nt805~824):5′-CA(A/G)AGACAAAAGAAAATTGG-3′。(4)PCR检测肝组织中HBV DNA含量:取肝组织中总DNA提取液用引物P29/P125检测,反应总体积23μl,其中总DNA提取液2μl,PCR 反应液19μl,引物P29/P125各0.5μl,Taq酶(1U/μl) 1μl;循环参数:94℃ 2min,94℃ 1min、60℃ 45s、72℃ 45s,共35个循环。取PCR产物7μl,20g/L琼脂糖凝胶电泳,应用GIS-2010凝胶成像分析系统进行分析并读取灰度值。(5)PCR检测肝组织中cccDNA的含量:取肝组织中HBV cccDNA的提取液用引物LB21/LB10进行检测,反应总体积26μl,其中cccDNA提取液2μl,PCR反应液22μl,引物LB21/LB10各0.5μl,Taq酶(U/μl)1μl;循环参数:94℃ 2min,94℃ 1min、68℃ 2min,共45个循环。取PCR产物7μl,20g/L琼脂糖凝胶电泳,应用GIS-2010凝胶成像分析系统进行分析并读取灰度值。
4. 荧光定量PCR检测血清中HBV DNA含量:按照HBV DNA PCR荧光定量诊断试剂盒使用说明书进行。
5. 统计学分析:采用SPSS11.5软件进行秩和检验、Spearman等级相关分析。
二、结果
1. PCR反应扩增目的片段:经反复实验优化PCR反应体系及反应条件,减少非特异性扩增。肝组织中cccDNA扩增片段长度为765bp(图1),肝组织中HBV DNA扩增片段长度为578bp(图2)。
2. 肝癌患者肝组织中HBV DNA和cccDNA的关系:20例肝癌患者中,17例(85%)在癌组织中检出HBV DNA,其灰度中位数为0.231,17例(85%)在癌旁组织中检出HBV DNA,其灰度中位数为0.829;但二者比较差异无统计学意义(P=0.701)。9例患者(45%)在癌组织中检出cccDNA, 其灰度中位数为0.100,13例患者(65%)在癌旁组织中检出cccDNA,其灰度中位数为0.214;但二者比较差异无统计学意义(P=0.213)。肝组织中的cccDNA与HBV DNA呈正相关(r=0.778,P<0.01)。
3. 肝癌患者血清中HBV DNA与肝组织中HBV DNA和cccDNA的关系:患者血清中的HBV DNA与其癌组织、癌旁组织的HBV DNA均呈正相关(r=0.789,P<0.01;r=0.589, P<0.01),患者癌组织、癌旁组织的cccDNA与其血清中的HBV DNA也均呈正相关(r=0.544,P<0.01;r=0.562,P<0.01)。其中9例患者虽然血清HBV DNA检测为阴性,但有3例(33.3%)在其癌组织、有5例(55.5%)在其癌旁组织中仍检测到cccDNA。
三、讨论
cccDNA是HBV DNA的复制中间体,是病毒感染得以维持的根源。HBV感染的肝癌患者在进行化疗或手术切除肿瘤的情况下,仍会出现HBV的再度激活,造成患者肝功能的恶化[5]。因此,了解肝癌组织及癌旁组织HBV cccDNA的存在状态,对于HBV感染的肝癌患者的抗病毒治疗具有十分重要的意义。然而,目前有关这方面的研究甚少。
由于在HBV感染的肝组织中存在不同复制阶段的HBV DNA,如cccDNA、rcDNA、单链DNA (ssDNA)、整合型HBV DNA等,增加了检测cccDNA的技术难度。本研究应用Plasmid-SafeTMATP依赖性DNA酶在微碱性pH条件下可消化线性双链DNA、线性单链DNA和环状单链DNA为脱氧核苷酸,而对闭合环状双链DNA或超螺旋DNA没有活性的特性来提取cccDNA[3];并设计跨越rcDNA两个缺口的引物,使rcDNA不被扩增,而cccDNA由于有完整的双链可以被选择性扩增,从而进一步提高了检测cccDNA的特异性。
香港Yuen等[6]检测92例发生HBsAg血清学清除的CHB患者,发现他们的肝组织学改善,但37%的患者体内仍存在低水平HBV DNA,并主要以cccDNA的形式存在。本研究中,所有肝癌患者HBsAg、抗HBe、抗HBc IgG阳性,HBeAg阴性,其中9例(45%)在癌组织、13例(65%)在癌旁组织中检出cccDNA,并且在部分血清HBV DNA阴性的患者中,仍可在其肝组织中检测到cccDNA。这些结果一方面说明cccDNA在HBV慢性感染的自然病程中,可能是持久存在的;另一方面提示我们通过检测肝组织中cccDNA,可以为临床指导抗HBV治疗提供重要依据。
有研究者提出cccDNA在肝脏中的分布是不均匀的[7],本研究分别检测了20例肝癌患者的癌组织及癌旁组织中HBV DNA及cccDNA,结果显示HBV DNA在癌组织及癌旁组织中不同(灰度中位数分别为0.231和0.829),cccDNA也是如此(灰度中位数分别为0.100和0.214),这一结果支持上述观点,但统计学分析结果显示,差异无统计学意义。
由于本研究采用半定量PCR方法,且样本量尚少,今后有必要进一步扩大样本含量,并完善检测方法。
参 考 文 献
[1]Addison WR, Walters KA, Wong WW, et al. Half-life of the duck hepatitis B virus covalently closed circular DNA pool in vivo following inhibition of viral replication. J Virol, 2002, 76: 6356-6363.
[2]Kock J, Baumert TF, Delaney WE 4th, et al. Inhibitory effect of adefovir and lamivudine on the initiation of hepatitis B virus infection in primary tupaia hepatocytes. Hepatology, 2003, 38: 1410-1418.
[3]Werle-Lapostolle B, Bowden S, Locarnini S, et al. Persistence of cccDNA during the natural history of chronic hepatitis B and decline during adefovir dipivoxil therapy. Gastroenterology, 2004, 126:1750-1758.
[4]Society of Liver Cancer. Criteria of the clinical diagnosis and staging for primary hepatocellular carcinoma. Zhonghua Ganzangbing Zazhi, 2001, 9: 324.
中国抗癌协会肝癌专业委员会.原发性肝癌的临床诊断与分期标准.中华肝脏病杂志,2001,9:324.
[5]Merican I, Guan R, Amarapuka D, et al. Chronic hepatitis B virus infection in Asian countries. J Gastroenterol Hepatol, 2000, 15: 1356-1361.
[6]Yuen MF, Wong DK, Sablon E, et al. HBsAg seroclearance in chronic hepatitis B in the Chinese: virological, histological, and clinical aspects. Hepatology, 2004, 39: 1694-1701.
[7]Zhang YY, Zhang BH, Theele D, et al. Single-cell analysis of covalently closed circular DNA copy numbers in a hepadnavirus-infected liver. Proc Natl Acad Sci U S A, 2003, 100: 12372-12377.
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